El programa de Doctorado en Ciencia y Tecnología de Alimentos surge en el Departamento de Alimentos como producto del acertado y organizado  avance de los programas de pregrado (tecnología e Ingeniería de alimentos)  y posgrado (especialización en Seguridad alimentaria y Maestría en Ciencia y Tecnología de alimentos).  Los cuales a lo largo de 33 años de existencia se han consolidado como programas académicamente estructurados y  científica y socialmente reconocidos.

El programa de doctorado fue concebido teniendo en primera instancia la infraestructura y capacidades científicas de la Universidad de Pamplona, por otro lado se realizó el  estudio de pertinencia en el cual fue determinante las necesidades del avance de la ciencia y tecnología de alimentos a nivel mundial, los objetivos de desarrollo sostenible de la FAO hacia el 2030, las políticas de la OMS, las políticas y planes de desarrollo, las necesidades de ciencia y tecnología de la región y el país y la responsabilidad Institucional ante la sociedad.

Derivado de lo anterior se estableció nuestra misión y visón y objetivos  alineados a las políticas y responsabilidades institucionales frente a la sociedad.