El sistema cunícola de la Granja Experimental Villa Marina se orienta a una producción integral y sostenible, destinada a la venta de gazapos, animales en etapa de levante y conejos para consumo. Este sistema incorpora principios de economía circular mediante el aprovechamiento de la conejaza como subproducto, la cual es utilizada en procesos de compostaje y posteriormente aplicada como abono orgánico en los cultivos de la granja, fortaleciendo el cierre de los ciclos productivos.

Desde el ámbito académico, la cunicultura permite a los estudiantes comprender esta actividad como una alternativa productiva viable, a través del manejo sanitario, nutricional y reproductivo de los animales. La alimentación se basa en forrajes como ramio y morera, complementados con alimento concentrado, y se trabaja con razas como Nueva Zelanda, Chinchilla, Californiano y Cabeza de León. La participación estudiantil en actividades técnicas fortalece el aprendizaje práctico y promueve la proyección del sistema hacia el mejoramiento productivo y la exploración de mercados.