Formar profesionales altamente competentes y con habilidades para realizar investigación científica que les permita diagnosticar, diseñar e implementar soluciones integrales innovadoras a los problemas que enfrentan los sistemas agropecuarios, con la máxima protección del medio ambiente y respeto a la cultura de la población rural.

Ser un programa educativo de maestría de excelencia reconocido a nivel departamental, nacional e internacional por su calidad en la formación de investigadores, con amplia preparación científica y líderes en el desarrollo de proyectos de investigación, para la generación y aplicación del conocimiento y el diseño sustentable de los sistemas agropecuarios.