El programa de Música de la Universidad de Pamplona, fue creado con fecha abril 15 de abril de 1999, bajo la denominación CARRERA PROFESIONAL EN MÚSICA. En su primera etapa el programa estuvo adscrito a la Facultad de Ciencias Socioeconómicas y Humanidades. La denominación académica del programa y su titulación son coherentes con la legislación colombiana, en lo estipulado en la ley 30 de 1992, Artículo 21, estableciendo, entre otras cosas, que los programas de pregrado en artes, conducen al título de maestro en música.