El microbiólogo de la Universidad de Pamplona recibe una amplia instrucción teórico-práctica en los diferentes campos que contempla la estructura curricular del programa, por tanto posee las herramientas y competencias suficientes para incursionar en cualquiera de las áreas de aplicación de la microbiología, con la posibilidad de seguir formándose en programas de postgrado (especialización, maestría, doctorado) según  el  área  de  su  preferencia.  De  igual  manera,  nuestro  profesional cuenta  con  la  capacidad  de interactuar de manera interdisciplinar en grupos de trabajo  o proyectos de investigación, vinculándose de manera dinámica en la formulación o ejecución, tanto en los aspectos técnicos y tecnológicos, así como en los científicos, de cualquier propuesta de investigación relacionada con su campo de formación. 

El egresado del programa de Microbiología de la Universidad de Pamplona es un profesional dinámico, crítico, emprendedor e integral, capacitado para:

• Llevar a cabo el control y aseguramiento de la calidad a procesos de producción y conservación de productos alimenticios, farmacéuticos, cosméticos, aguas potables, residuales y cualquier otro producto susceptible de contaminación y/o degradación por microorganismos.

• Dirigir y/o participar activamente en el diseño, ejecución y verificación de planes de calidad; además de proponer, interpretar y aplicar adecuadamente la normatividad correspondiente en el área de aplicación de la Microbiología.

• Formular y desarrollar proyectos de I+D+I en las áreas de su formación disciplinar.

• Participar en el desarrollo de procesos biotecnológicos y/o agroindustriales que involucren la presencia y el aprovechamiento de microorganismos y/o sus metabolitos, para la mitigación ambiental o la obtención de nuevos productos, bienes o servicios.

• Participar en la estandarización y validación de métodos y técnicas de análisis microbiológico para su aplicación en diversos sectores de la industria.

• Dirigir y/o coordinar centros de investigación, innovación y desarrollo tecnológico relacionadas con las áreas de acción de su profesión.

• Comunicar adecuadamente la información generada en procesos de investigación, de prestación de servicios y/o de solución de problemas, en el campo específico de formación.